中原工学院2003年获批硕士学位授权单位，现拥有13个一级学科硕士学位授权点（应用经济学、马克思主义理论、机械工程、信息与通信工程、控制科学与工程、材料科学与工程、计算机科学与技术、土木工程、纺织科学与工程、工商管理、设计学、哲学和网络空间安全），涵盖60个二级学科硕士学位授权点，17个硕士专业学位授权类别（法律硕士、新闻与传播硕士、电子信息硕士、机械硕士、材料与化工硕士、能源动力硕士、土木水利硕士、工商管理硕士、会计硕士、工程管理硕士、艺术硕士、金融硕士、应用统计硕士、审计硕士、社会工作硕士、翻译硕士和交通运输硕士），涵盖工、管、文、经、法、哲、艺等学科门类。现有校内研究生培养单位19个，包括17个二级学院和2个研究院，在读研究生2001人，硕士研究生导师1121人（其中校内导师625人，校外496人）。
2015年，学校获批“纺织服装新材料及高端装备”省级a类优势特色学科群，中期检查获评优秀，并顺利通过终期验收。2020年获批“智能与航空信息技术”和“纺织服装新材料及高端装备”2个河南省特色骨干学科群，智能与航空信息技术学科群，依托信息与通信工程、控制科学与工程、电气工程、计算机科学与技术等一级学科，纺织服装新材料及高端装备学科群，依托纺织科学与工程、机械工程、材料科学与工程等一级学科。2023年获批“智慧新能源”河南省特需急需特色骨干学科群，依托动力工程及工程热物理、电子科学与技术、化学工程与技术、环境科学与工程等学科。在新一轮河南省重点学科中，我校获批省级重点学科9个：应用统计、马克思主义理论、物理学、土木工程、软件工程、电子信息、能源动力、工商管理学、设计学。2017年，纺织学科在全国第四轮学科评估中进入c类，全国排名第九。学校2018年获批河南省博士授予立项建设单位，2021年获批河南省博士学位重点立项培育单位。
学校先后获批河南省研究生教育优质课程9项，河南省研究生课程思政示范课程3项，河南省研究生精品在线课程3项，河南省研究生精品教材项目3项，河南省研究生教育创新培养基地9项，河南省特色品牌硕士专业学位授权点（工程硕士领域）2项，河南省专业学位研究生精品教学案例项目15项，河南省高等教育教学改革研究与实践项目（研究生教育）18项、重点项目4项和一般项目14项，先后有57篇硕士学位论文入选河南省优硕学位论文。（更新于2024年3月25日）